好氧发酵法，利用此法，可较好地解决粪便造成的污染问题。根据处理后的不同用途及作物的不同吸肥特性，可制成生物饲料，如反色动物饲料、宠物饲料或制成有机肥、有机复合肥、复混肥、生物菌肥等颗粒肥料。但是，己有的试验结果表明，适宜的堆肥水分含量一般为50%-60%，而新鲜猪粪的含水量高达80%-85%，非垫料或非冲洗禽畜粪便的含水量一般在60%85%，要将禽畜粪便水分含量调节到适宜的程度有一定的难度。而采用堆肥方式处理禽畜粪便时，其含水量在40%，微生物降解作用较活跃，而在46℃温度下，每1g水1. 4L通气量条件下，可以获得较大的干燥速度。所以脱水能够节省堆肥处理粪便时间和人力。TomL Richard (1998)应用Arrhenius酶动力学方程与Albright (1990)的化学计量式方程对温度、通气速度等因子与水分散发速率的关系进行了描述，并建立了相应的模型，推断：每天每千克可挥发固体物可移去lkg水，也就是说，每天每消耗lkg固体物可以使粪便水量由70%下降到57%。在堆肥处理粪便脱水过程中尤其是含水量较高时需要大量的垫料，如稻草、木屑，大量垫料的使用增加了堆肥处理的成本。大型养殖场在处理禽畜粪便时首先就是对其固液分离，然后对固体和液体分别处理。目前固液分离基本完全使用机械分离，耗能较大。
所以，研究禽畜粪便的水势及其变化，探索出如何在处理(发酵)前通过生物方法降低禽畜粪便的含水量的技术对于粪便的减容、贮藏、加工运输及使用十分重要，而如何有效且又经济地降低粪便水分含量是禽畜粪便处理的一个重要课题。
规模化养殖场粪污水处理中，固液分离是处理工艺的关键环节，选择、使用合理的固液分离工艺和固液分离机至关重要。从规模化排出的粪污水水量较大，固形物浓度较低，一般在3%左右，难以直接应用先进的发酵工艺及养殖粪便综合利用。如要直接应用先进的发酵工艺及养殖粪便综合利用，其前提条件就是对粪便污水进行前处理—固液分离，粪污水经固液分离后，干物质可制成有机复合肥，不仅改善养殖场环境，减少臭气，防止致病微生物的扩散，降低污水中COD， BOD， TS的含量，而且为农田提供了有机肥，有利于农田的增产增收，改良土壤和生态农业的良性循环。
经固液分离后，污水中COD下降40%左右，为高效的厌氧工艺创造条件，若COD(或SS)过高，则可能堵塞高效过滤器，不能发挥高效工艺作用。分离出的液体，其TS， COD大大下降，可减轻后期处理的负荷，缩小厌氧处理装置的容积和占地面积，降低造价。同时厌氧消化后出水的COD浓度下降，厌氧污泥生成量大为减少，这便于后期好氧处理，达到排放标准。因此技术已成为养殖污水处理工程及粪便综合利用的关键，选择、使用合理的固液分离技术和工艺至关重要。
